CBSM

Center for Bioinformatics, Simulations and Modelling

First in Latin America, the University of Talca established a School of Engineering in Bioinformatics

Since 2004, scientific work has been conducted within the Bioinformatics Engineering School, and the continuous development of new research projects led to the legal establishment of the Center for Bioinformatics, Simulations, and Modeling (CBSM) in April 2012. The foundation of the CBSM resulted in the creation of an organizational structure within the center, ensuring sustainability and long-term projection.

The CBSM promotes the development of young scientists qualified to generate knowledge in the areas of Structural Biology, Genomics, Computational Chemistry, and Biophysics. It offers a multidisciplinary work environment supported by scientists with diverse backgrounds in natural sciences such as Biology, Chemistry, Physics, Genomics, and Pharmaceutical Sciences, among others.

Each year, Ph.D. candidates from various doctoral programs join the CBSM to collaborate with our scientists. Likewise, students from the Bioinformatics Engineering School have the opportunity to participate in ongoing and cutting-edge research projects. On average, 10 Bioinformatics students complete their final theses at the CBSM annually.

Bridging Computational and Experimental Sciences: The Role of CBSM in Advancing Bioinformatics

The creation of the CBSM facilitates the establishment of collaborations with national and international institutions beyond the University of Talca. A particular focus is placed on fostering partnerships that bridge computational sciences, such as Bioinformatics, with experimental sciences. This connection enhances the generation of scientific knowledge by leveraging well-established methodologies from both fields to sharpen and enrich research efforts.

Furthermore, the establishment of the CBSM has allowed it to position itself as a center of excellence, contributing to the recognition of the Bioinformatics Engineering School as a leading institution within the higher education system.

Objectives of CBSM

The CBSM aims to guide research in the field of Bioinformatics at the University of Talca and beyond, thereby supporting progress and innovation in other scientific areas such as Biotechnology, Medicine, and Agriculture.

To fulfill this mission, the following objectives are pursued:

Efficiently manage the financial, scientific, and human resources of the Bioinformatics Engineering School to maximize scientific output.
Generate new knowledge in the field of Bioinformatics and contribute to the training of highly qualified scientists.
Develop tools for technology transfer and implement activities that provide advanced training and skill development.

Public or private institutions (national and international) associated with the Center

National

Universidad de Chile

Mónica Cáceres. Facultad de Medicina, Instituto de Ciencias Biomédicas; colaboración con Ariela Vergara
Felipe del Canto. Facultad de Medicina; colaboración con Mauricio Arenas
Diego Varela. Facultad de Medicina; colaboración con Wendy González, Ariela Vergara, Horacio Poblete
Oscar Cerda. Facultad de Medicina; colaboración con Wendy González, Ariela Vergara, Horacio Poblete y Gonzalo Riadi
Victor Castro, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología; colaboración con Jans Alzate-Morales
Marcelo Kogan, Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas; colaboración con Horacio Poblete
Roberto Vidal. Facultad de Medicina; colaboración con Mauricio Arenas
Paola Krall. Departamento de Pediatría y Cirugía Infantil Oriente (Hospital Dr. Luis Calvo Mackenna-Universidad de Chile). Colaboración con Wendy González

Fundación Ciencias y Vida

Raquel Quatrini; colaboración con Mauricio Arenas

Universidad de Santiago de Chile

Carlos Vera. Facultad de Química y Biología; colaboración con Mauricio Arenas
Felipe Arenas. Facultad de Química y Biología; colaboración con Mauricio Arenas
Alexis Aspee; colaboración con Horacio Poblete
Maria Pertusa, Laboratorio de Neurociencia, Departamento de Biología, Facultad de Química y Biología; colaboración con Janin Riedelsberger y Jans Alzate-Morales
Miguel Reyes; colaboración con Jans Alzate-Morales, Wendy González
Rodolfo Madrid, colaboración con Wendy González
Ingrid Ponce. Facultad de Química y Biología, colaboración con Horacio Poblete.

Universidad Austral de Chile

Sebastián Brauchi; colaboración con Ariela Vergara, Horacio Poblete y Gonzalo Riadi.
Gaspar Peña; colaboración con Horacio Poblete y Wendy González.
Marcelo Catalán; colaboración con Wendy González.

Universidad de Concepción

Lleretny Rodriguez; colaboración con Gonzalo Riadi
Fidel Ovidio Castro; colaboración con Gonzalo Riadi
David Ramírez, colaboración con Ingo Dreyer, Wendy González y Ariela Vergara

Centro de Estudios Científicos (CECs)

Francisco Sepúlveda; colaboración con Wendy Gonzalez

Universidad de la Frontera

Patricio Iturriaga; colaboración con Jans Alzate-Morales

Universidad Católica del Maule

Ingrid Carvacho; colaboración con Ariela Vergara.
Ramon Pérez; colaboración con Mauricio Arenas
Mauricio Bedoya; colaboración con Wendy González y Jans Alzate-Morales

Pontificia Universidad Católica de Chile

Maria Estela Andrés; colaboración con Ariela Vergara, Horacio Poblete, y Gonzalo Riadi
Carlos Oliva; colaboración Ariela Vergara, Horacio Poblete, y Gonzalo Riadi
Juliana Vianna; colaboración con Gonzalo Riadi

Universidad Nacional Andrés Bello (UNAB)

Juliana Murillo; colaboración con Jans Alzate-Morales
Jorge Soto-Delgado; colaboración con Jans Alzate-Morales
Fernando Faunes; colaboración con Ariela Vergara, Horacio Poblete, y Gonzalo Riadi
Alberto Cornejo. Escuela de Tecnología Médica, Facultad de Medicina; colaboración con Julio Caballero

Universidad Mayor

Gabriel Abarca; colaboración con Horacio Poblete

Universidad de los Andes

Federico Batiz, colaboración con Wendy González

Universidad San Sebastián (sede Valdivia)

Juan Opazo; colaboración con Braulio Valdebenito, Ariela Vergara, Horacio Poblete, Gonzalo Riadi y Wendy González
Paola Murgas; colaboración con Gonzalo Riadi

Centro de Investigación y Desarrollo de la Viña Concha y Toro

Felipe Gainza, colaboración con Gonzalo Riadi

Universidad de Valparaíso

Andrea Calixto; colaboración con Gonzalo Riadi
David Naranjo; colaboración con Horacio Poblete

Universidad del Desarrollo

Mauricio Retamal, colaboración con Wendy González
Iván Alfaro, colaboración con Wendy González

Universidad de Talca

Erwan Michard, Instituto de Ciencias Biológicas; colaboración con Ingo Dreyer y Janin Riedelsberger
Raul Herrera, Instituto de Ciencias Biológicas; colaboración con Ingo Dreyer
Leandro Zúñiga, Escuela de Medicina; colaboración con Wendy González
Margarita Gutiérrez, Instituto de Química; colaboración con Wendy González
Cristian Vilos, Escuela de Medicina; Colaboración con Horacio Poblete y Wendy González
Renzo Angles. Facultad de ingeniería; colaboración con Mauricio Arenas y Wendy González
Jorge Villaseñor; Instituto de Química; colaboración con Mauricio Arenas
Esteban Duran, Facultad de Ciencias de la Salud; colaboración con Mauricio Arenas y Wendy González
Francisco Zamudio de la Facultad de Ciencias de la Salud; colaboración con Gonzalo Riadi.

International

Universidad Politécnica de Madrid

Stephan Pollmann; colaboración con Ingo Dreyer

Cornell University / USDA-ARS, Ithaca, New York, USA

Lailiang Cheng, Section of Horticulture, School of Integrative Plant Science; colaboración con Janin Riedelsberger
Elena Michel and Dr. Klaas J. van Wijk, Plant Biology Section, School of Integrative Plant Science; colaboración con Janin Riedelsberger
Miguel Piñeros; Robert W. Holley Center for Agriculture and Health USDA-ARS, colaboración con Janin Riedelsberger, Ingo Dreyer y Gonzalo Riadi

Humboldt University, Berlin, Germany

Christina Kühn, Faculty of Life Sciences Institute of Biology, Plant Physiology; colaboración con Janin Riedelsberger

University, Marburg, Germany

Niels Decher; colaboración con Wendy Gonzalez

Universidad de Valencia, España

Iñaki Tuñón; colaboración con Jans Alzate-Morales y Julio Caballero
Kirill Zinovjev, colaboración con Jans Alzate-Morales

Instituto Pasteur de Montevideo, Uruguay

Sergio Pantano; colaboración con Jans Alzate-Morales y Julio Caballero

Universidad de Copenhagen, Dinamarca

Husan H. Nour-Eldin; colaboración con Ingo Dreyer

Pontificia Universidad Católica del Ecuador, Quito, Ecuador

Lorena Meneses Olmedo, Departamento de Química; colaboración con Jans Alzate-Morales

Kansas State University, Kansas, USA

Jeffrey Comer, College of Veterinary Medicine; colaboración con Horacio Poblete y Wendy González

Heinrich-Heine University, Dusseldorf, Alemania

Holger Gohlke, Computational Pharmaceutical Chemistry Group; colaboración con Jans Alzate-Moralesy Ingo Dreyer

University of Pavia, Italia

Simona Collina; colaboración con Julio Caballero

Universidad de La Habana, Cuba

Luis Montero Cabrera; colaboración con Julio Caballero
Roy González-Alemán; colaboración con Julio Caballero

Universidad de Ottawa, Canada

Emilio Alarcón; colaboración con Horacio Poblete

Universidad de Guadalajara, México

Asdrubal Burgos; colaboración con Wendy Gonzlez

UC Davis, USA

Vladimir Yarov-Yarovoy; colaboración con Wendy Gonzlez

Universidad de Freiburg, Alemania

Ursula Ravens; colaboración con Wendy Gonzlez

University of Würzburg, Germany

Rainer Hedrich; colaboración con Ingo Dreyer
Irene Marten; colaboración con Ingo Dreyer
Rob Roelfsema; colaboración con Ingo Dreyer
Dietmar Geiger; colaboración con Ingo Dreyer

University of Köln, Germany

Alga Zuccaro; colaboración con Ingo Dreyer

Virginia Tech, USA

Guillaume Pilot; colaboración con Ingo Dreyer y Janin Riedelsberger

Universidad Politécnica de Cataluña, BarcelonaTech, España

Daniel Jiménez-González; colaboración con Wendy González

Universidad Nacional de Córdoba, Argentina

Marcelo Mariscal; colaboración con Jans Alzate-Morales

University of Bristol, Bristol, Reino Unido

Marc Van der Kamp, School of Biochemistry; colaboración con Jans Alzate-Morales

Universitat Jaume I, Castellón, España

Vicent Moliner, BioComp Group; colaboración con Jans Alzate-Morales

Universidad Autónoma de México-Iztapalapa, Ciudad de México, México

Joel Ireta Moreno; colaboración con Jans Alzate-Morales

University of Maryland, USA

Jose Feijo; colaboración con Ingo Dreyer

Universidad Yachay Tech, Ecuador

Mariela Pérez; colaboración con Ariela Vergara
Julio Chacón, colaboración con Horacio Poblete.

Centro Nacional de Biotecnología, Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CNB-CSIC), Madrid, España

Roberto Solano, Department of Plant Molecular Genetics; colaboración con Julio Caballero

Universidad Santander, Instituto de Investigación Masira, Bucaramanga, Columbia

Efraín Pinzón-Reyes; colaboración con Janin Riedelsberger y Jans Alzate-Morales

Universidad de Durham, UK.

Ehmke Pohl, colaboración con Mauricio Arenas

Universidad de Oxford

Blanca Rodríguez, colaboración con Wendy González

University of Nebraska-Lincoln, Nebraska, USA

Jay F. Storz; colaboración con Gonzalo Riadi

Universidad Autónoma de Barcelona

Ángel González Wong, colaboración con Wendy González

University Claude Bernard Lyon 1

Olga Andrini, colaboración con Wendy González

University of Fribourg, Switzerland

Markus Geisler; colaboración con Ingo Dreyer